Un beug du moment :
On ne peut indiquer qu'une seule fois ipv6only=on dans toute la config Nginx.

Comme l'indique joohoi :

To shed some light on the issue:
ipv6only option is used to be able to handle multiple listen statements per socket. Unfortunately it can only be used once in the server configuration for the socket. So Nginx will fail to start in case of:

Pour les versions Nginx >= 1.3.4, ipv6only=on est inutile puisque c'est la valeur par défaut.